หลังจากที่ได้สิทธิในการลงแข่งขันมาจากมหาวิทยาลัยราชพฤกษ์ จึงได้ก่อตั้งสโมสรขึ้นมาใหม่ในชื่อ นครศรีธรรมราช ยูนิตี้ โดย พิชญ์ปวีร์ บุณยเกียรติ ที่เคยเป็นรองประธานสโมสรของนครศรีเฮอริเทจ ได้เข้ามาเป็นประธานสโมสรของนครศรีธรรมราช ยูนิตี้ หลังจากนั้นในฤดูกาล 2018 นายปิยะชาติ ศิริปะชะนะ เจ้าของธุรกิจกลุ่ม NAZA GROUP ได้เข้ามาเทคโอเวอร์สโมสร และเปลี่ยนชื่อเป็น สโมสรนครศรียูไนเต็ด และในฤดูกาล 2020 สส.ชนนพัฒฐ์ นาคสั้ว ได้เข้ามาดูแลทีมฟุตบอลนครศรียูไนเต็ด พร้อมกับเปลี่ยนสัญลักษณ์สโมสรใหม่ปัจจุบันนี้ ได้ปรับเปลี่ยนคณะกรรมการบริหารสโมสรฯ ใหม่ เป็น นางสาวกฤตพร คงเคว็จ เพื่อให้การจัดการทีมในการเตรียมทีมให้มีความพร้อมสูงสุด ในการดำเนินงาน
